由于非淋菌性尿道炎本来症状即轻，治疗后症状就更不明显了，但不能认为本病已经治好。也有的患者经治疗后，大夫告诉他已经治好，但患者仍有一些不适症状。这两种情况都令人迷惑，怎样才能算治好呢？判定治好的标准既不能有用根据症状，也不能不考虑患者的自觉症状。没有症状如化验检查证明仍有衣原体或支原体，也说明病情未得到控制。而患者有不适的症状，经至少3次化验检查证明均为阴性，可以说已经治好。